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慢病毒系列|让你“为所欲为”调控基因(热门研究篇)

时间:2022-09-16 热度:


非编码RNA与疾病研究
 

 人类基因组中研究得最多的是编码卵白质的基因序列,,, ,仅占基因组的1.5%,,, ,若是思量非编码区(UTR)将增添至2%。。。近年研究发明,,, ,基因组的非编码部分对机体的正常发育、心理和疾病至关主要,,, ,其功效与疾病爆发的相关性研究早期聚焦在microRNA(miRNA)上。。。然而,,, ,miRNA只是冰山一角,,, ,其他非编码RNA(ncRNA),,, ,如环状RNA(circRNA)、长链非编码RNA (lncRNA)、核仁小RNA (snoRNA)等的异质性不但与肿瘤的爆发相关,,, ,还与神经、心血管、发育等多种疾病相关。。。 

研究最普遍的一类是miRNA,,, ,这是一种长度约为22个核苷酸(nt)的小非编码RNA,,, ,它通过控制mRNA翻译成卵白质来介导转录后基因默然。。。据预计,,, ,miRNA调控凌驾60%编码基因的卵白质翻译,,, ,加入包括增殖、分解、凋亡和发育等历程。。。 

环状RNA(circRNA)是一类特殊的ncRNA分子,,, ,不受RNA外切酶影响,,, ,表达更稳固,,, ,不易降解,,, ,也是新的研究热门。。。近期研究批注,,, ,circRNA富含miRNA连系位点,,, ,起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,,, ,进而扫除miRNA对其靶基因的抑制作用。。。通过与疾病关联的miRNA相互作用,,, ,circRNA在疾病中施展着主要的调控作用。。。 

长链非编码RNA (lncRNA)是一组长度凌驾200nt的非编码转录本,,, ,加入多种生物学历程,,, ,是哺乳动物非编码转录组中最多的一类。。。现在提出lncRNA对基因表达的转录调控机制是通过招募染色质复合物重塑到特定位点来介导DNA的表观遗传修饰。。。 

慢病毒有适用宿主规模广、熏染效率高、具有生物清静性、整合基因到宿主细胞实现恒久稳固表达的特点,,, ,被普遍应用于疾病的机制与爆发生长的研究中。。。UG环球生物自主研发获批专利的Vpack慢病毒包装系统,,, ,能够攻克了病毒不出毒和滴度低的问题,,, ,包管lncRNA表达更准确,,, ,载体荧光表达更亮,,, ,病毒出毒更稳固。。。周全知足您在热门研究中对基因编辑的需求。。。下面就一起来相识怎样应用慢病毒玩转热门研究。。。 


lncRNA——原系统 VS Vpack系统

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案例1——慢病毒&microRNA(滋扰)
 

M2 microglia-derived extracellular vesicles promote white matter repair and functional recovery via miR-23a-5p after cerebral ischemia in mice

作者单位:上海交通大学

IF:11.6

 

脑白质修复对缺血性卒中后的认知和神经功效恢复至关主要。。。M2型小胶质细胞被证实可增进髓鞘再生,,, ,其细胞外囊泡(EVs)介导脑损伤后的细胞功效修复。。。然而,,, ,M2型小胶质细胞泉源的EVs在增进脑缺血后的脑白质修复及其潜在机制尚不清晰。。。本研究证实M2-EVs可缩小脑萎缩体积,,, ,增进体内功效恢复、少突胶质天生和白质修复,,, ,增添体外少突胶质祖细胞(OPC)增殖、存活和分解。。。miR-23a-5p在M2-EVs中富集,,, ,可以增进OPC的增殖,,, ,存活和成熟,,, ,而在M2-EVs中敲低miR-23a-5p可以逆转M2-EVs在体内外的有益作用。。。M2型小胶质细胞可通过M2-EVs与OPCs相同,,, ,并通过miR-23a-5p增进白质修复,,, ,其机制可能与miR-23a-5p直接靶向Olig3有关,,, ,提醒M2-EVs有望成为脑卒中和脑白质脱髓鞘修复的新治疗战略。。。 

图1:由M2-EV所提供的miR-23a-5p在增进少突胶质原爆发中是必不可少的

Yongfang Li et al., Theranostics. 2022; 12(7): 3553-3573.

 

★细胞系:小神经胶质细胞BV2

★基因调控手段:基因滋扰(LV-sh miR-23a-5p)

 

UG环球生物有幸提供本文所涉及的基因滋扰慢病毒包装效劳

  

案例2——慢病毒&microRNA(过表达)


Exosome-Mediated miR-21 Was Involved in the Promotion of Structural and Functional Recovery Effect Produced by Electroacupuncture in Sciatic Nerve Injury.

作者单位:上海中医药大学

IF:7.31

 

本研究旨在探讨电针通过调理外泌体的释放及外泌体介导的miRNA-21 (miR-21)转达增进神经再生的机制,,, ,进一步研究施万细胞 (SC)泉源的外泌体对miR-21过表达治疗外周神经损伤(PNI)的影响。。。研究发明电针在PNI模子大鼠的早期阶段抑制血清外泌体miR-21的释放,,, ,而在后期阶段增进其释放。。。电针增强miR-21在损伤神经中的群集,,, ,有用增进PNI后神经功效的恢复。。。当通过miR-21-5p-sponge抑制循环外泌体的释放或下调损伤局部组织中miR-21的表达时,,, ,电针的治疗效果削弱。。。正常SC渗透的外泌体具有增进神经功效恢复的能力,,, ,而miR-21过表达增强了外泌体的这一作用。。。别的,,, ,SC渗透的外泌体miR-21可增进神经突在体外生长。。。外泌体介导miR-21转运展现了电针对PNI的作用机制,,, ,为使用外泌体介导的miR-21作为治疗PNI的新战略提供了理论基础。。。

 

图2:外泌体miR-21调控坐骨神经远端基因表达水平

Yu-pu Liu et al., Oxidative Medicine and Cellular Longevity. 2022 Jan 29.

 

★细胞系:施万细胞(周围神经系统中的神经胶质细胞称施万细胞)

★基因调控手段:基因过表达(LV-miR-21-5p-OE)


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案例3——慢病毒&circular RNA(滋扰)


CircMET promotes tumor proliferation by enhancing CDKN2A mRNA decay and upregulating SMAD3

作者单位:南京大学

IF:41.444

 

circMET (hsa_circ_0082002)是一种泉源于MET基因的环状RNA,,, ,其功效尚不完全清晰。。。本研究以circMET上调的Xp11.2易位/NONO-TFE3融合性肾细胞癌(NONO-TFE3 tRCC)为研究工具,,, ,探讨其在肿瘤希望和转录后调控中的机制。。。研究批注:NONO-TFE3 tRCC组织和细胞中,,, ,NONO-TFE3融合上调circMET的表达,,, ,过表达circMET显著增进NONO-TFE3 tRCC的生长。。 ;;;蒲芯恐な,,, ,circMET通过YTHDC1以N6 -甲基腺苷(m6A)依赖的方法被递送到细胞质中。。。circMET通过直接相互作用并召募YTHDF2来增强CDKN2A mRNA的衰减,,, ,同时circMET竞争性消除miR-1197并抑制SMAD3 mRNA的表达。。。综上所述,,, ,circMET增进NONO-TFE3 tRCC的爆发生长并对CDKN2A和SMAD3均有调控作用。。。circMET有望成为NONO-TFE3 tRCC以及其他高表达circMET的肿瘤治疗的新靶点。。。 

图3:高表达circMET增进NONO-TFE3 tRCC的增殖

Yang et al., Molecular Cancer. 2022 Jan 18;21(1):23.

 

★细胞系:UOK109(泉源于原发性乳头状细胞癌)、786-O(人肾透明细胞癌细胞)

★基因调控手段:基因滋扰(LV-sh circMET)

 

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案例4——慢病毒&circular RNA(敲低)


Down-regulating Circular RNA Prkcsh suppresses the inflammatory response after spinal cord injury

作者单位:山东大学齐鲁医院

IF:6.058

 

环状RNA (Circular RNAs, circRNAs)是一类守旧的内源性非编码RNA,,, ,加入转录和转录后基因调控,,, ,在神经系统中高度富集。。。它们加入多种神经细胞的存活和分解,,, ,甚至可能增进卒中后神经功效的恢复。。。研究职员使用小鼠T9脊髓损伤模子判断出脊髓损伤后差别表达的circRNA和miRNA。。。其中,,, ,circPrkcsh的表达水平在损伤小鼠和比照小鼠之间保存显著差别。。。肿瘤坏死因子-α(TNF-α)刺激体外作育的星形胶质细胞,,, ,用以模拟脊髓损伤后的炎症反应。。。效果批注,,, ,在损伤的细胞中circPrkcsh表达升高,,, ,miR-488表达降低,,, ,同时发明circPrkcsh调控炎症相关基因Ccl2的表达。。。别的,,, ,在TNF-α处置惩罚的星形胶质细胞中,,, ,circPrkcsh敲低通过上调miR-488的表达降低了Ccl2表达,,, ,并镌汰体外炎症因子的渗透。。。综上可知,,, ,差别表达的circRNA加入脊髓损伤后的炎症反应,,, ,并作为某些miRNA的调理者。。。circPrkcsh可作为miR-488海绵吸附调控Ccl2的表达,,, ,为脊髓损伤的治疗提供新的思绪。。。

图4:circPrkcsh在体外通过海绵吸附miR-488调控Ccl2的表达。。。

Jia-Nan Chen et al., Neural Regen Res. 2022 Jan;17(1):144-151.

 

★细胞系:小鼠星形胶质细胞(原代细胞)

★基因调控手段:基因过表达(LV-miR-488-OE)、基因敲低(LV-miR-488-KD)


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案例5——慢病毒&Long non-coding RNA(过表达)


Long non-coding RNA EVADR induced by Fusobacterium nucleatum infection promotes colorectal cancer metastasis

作者单位:第三军医大学(陆军军医大学)

IF:9.995

 

具核梭杆菌(F. nucleatum)和长链非编码RNA (lncRNA) EVADR均与结直肠癌(CRC)相关,,, ,但它们与CRC转移的关系以及EVADR增进CRC转移的机制尚不清晰。。。我们在这里报告了F. nucleatum增进结直肠癌细胞转移到肝和肺,,, ,并且在小鼠模子的CRC转移定植中可以检测到它。。。别的,,, ,F. nucleatum可上调EVADR的表达,,, ,从而增添CRC细胞体内外转移能力。。。在机制上,,, ,EVADR升高可作为Y盒连系卵白1 (YBX1)的???榛Ъ,,, ,直接增强上皮-间充质转化(EMT)相关因子的翻译,,, ,如Snail, Slug和Zeb1。。。这些效果批注,,, ,F. nucleatum诱导的EVADR通过YBX1依赖的翻译增进CRC的转移。。。EVADR/YBX1轴可能有助于F. nucleatum相关CRC转移的预防和治疗。。。 

图5:F. nucleatum熏染诱导的EVADR增进结直肠癌转移。。。

Xiaoxue Lu et al., Cell Reports. 2022 Jul 19;40(3):111127.

 

★细胞系:5种结直肠癌细胞(HCT116, LoVo, SW480, SW620 and HT29)、正常结肠上皮细胞系(NCM460)

★基因调控手段:基因过表达(LV-EVADR-OE)


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案例6——慢病毒&Long non-coding RNA(过表达)


An oxygen-adaptive interaction between SNHG12 and occludin maintains blood-brain barrier integrity

作者单位:中国医科大学

IF:9.995

 

脑微血管内皮细胞(brain microvascular endothelial cells, BMECs)的细密毗连(Tight junctions, TJs)在维持血脑屏障(blood-brain barrier, BBB)完整性中起着要害作用。。。然而,,, ,在心理和病理刺激下,,, ,TJs稳固性的准确调控仍然是未知的。。。研究使用RNA免疫沉淀连系二代测序(RIP-seq)和功效判断,,, ,发明一个长链非编码RNA (lncRNA)—SNHG12,,, ,通过直接与TJ卵白occludin相互作用,,, ,对维持BBB的完整性至关主要。。。SNHG12和occludin之间的相互作用是氧顺应性的,,, ,可以阻断人BMECs中Itch (E3泛素毗连酶)介导的occludin泛素化和降解。。。小鼠内皮细胞敲除SNHG12基因会导致occludin镌汰和BBB渗漏以及加重缺氧诱导BBB的破损。。。脑内皮细胞过表达外源性SNHG12可减轻缺氧对BBB的损害。。。综上所述,,, ,研究发明了一个lncRNA对BBB完整性维持和氧顺应至关主要的直接TJ调理剂——SNHG12。。。 

图6:SNHG12和occludin之间的氧顺应性相互作用维持了血脑屏障的完整性。。。

Yuan Li et al., Cell Reports. 2022 Apr 12;39(2):110656.

 

★细胞系:人/小鼠脑微血管内皮细胞(HBMECs、MBMECs)

★基因调控手段:基因过表达(LV-SNHG12-OE)


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UG环球生物一直致力于病毒载体的研制效劳,,, ,拥有10万+的病毒包装履历/4.6万+病毒载体库,,, ,包装GMP级别的病毒质粒。。。UG环球生物拥有多种慢病毒包装系统:三质粒/四质粒包装系统。。。

 

UG环球生物可提供过表达/滋扰、CRISPR/Cas9、Cumate诱导表达系统、Tet-on/off系统、Cre-loxp系统等专属您的定制慢病毒,,, ,同时也涵盖CRISPR/Cas9敲除或激活文库、自噬单标或双标、萤光素酶现货慢病毒产品。。。

 

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