慢病毒系列|让你“为所欲为”调控基因(热门研究篇)
非编码RNA与疾病研究
lncRNA——原系统 VS Vpack系统
案例1——慢病毒&microRNA(滋扰)
M2 microglia-derived extracellular vesicles promote white matter repair and functional recovery via miR-23a-5p after cerebral ischemia in mice
作者单位:上海交通大学
IF:11.6
脑白质修复对缺血性卒中后的认知和神经功效恢复至关主要。。。M2型小胶质细胞被证实可增进髓鞘再生,,,,其细胞外囊泡(EVs)介导脑损伤后的细胞功效修复。。。然而,,,,M2型小胶质细胞泉源的EVs在增进脑缺血后的脑白质修复及其潜在机制尚不清晰。。。本研究证实M2-EVs可缩小脑萎缩体积,,,,增进体内功效恢复、少突胶质天生和白质修复,,,,增添体外少突胶质祖细胞(OPC)增殖、存活和分解。。。miR-23a-5p在M2-EVs中富集,,,,可以增进OPC的增殖,,,,存活和成熟,,,,而在M2-EVs中敲低miR-23a-5p可以逆转M2-EVs在体内外的有益作用。。。M2型小胶质细胞可通过M2-EVs与OPCs相同,,,,并通过miR-23a-5p增进白质修复,,,,其机制可能与miR-23a-5p直接靶向Olig3有关,,,,提醒M2-EVs有望成为脑卒中和脑白质脱髓鞘修复的新治疗战略。。。
图1:由M2-EV所提供的miR-23a-5p在增进少突胶质原爆发中是必不可少的
Yongfang Li et al., Theranostics. 2022; 12(7): 3553-3573.
★细胞系:小神经胶质细胞BV2
★基因调控手段:基因滋扰(LV-sh miR-23a-5p)
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案例2——慢病毒&microRNA(过表达)
Exosome-Mediated miR-21 Was Involved in the Promotion of Structural and Functional Recovery Effect Produced by Electroacupuncture in Sciatic Nerve Injury.
作者单位:上海中医药大学
IF:7.31
本研究旨在探讨电针通过调理外泌体的释放及外泌体介导的miRNA-21 (miR-21)转达增进神经再生的机制,,,,进一步研究施万细胞 (SC)泉源的外泌体对miR-21过表达治疗外周神经损伤(PNI)的影响。。。研究发明电针在PNI模子大鼠的早期阶段抑制血清外泌体miR-21的释放,,,,而在后期阶段增进其释放。。。电针增强miR-21在损伤神经中的群集,,,,有用增进PNI后神经功效的恢复。。。当通过miR-21-5p-sponge抑制循环外泌体的释放或下调损伤局部组织中miR-21的表达时,,,,电针的治疗效果削弱。。。正常SC渗透的外泌体具有增进神经功效恢复的能力,,,,而miR-21过表达增强了外泌体的这一作用。。。别的,,,,SC渗透的外泌体miR-21可增进神经突在体外生长。。。外泌体介导miR-21转运展现了电针对PNI的作用机制,,,,为使用外泌体介导的miR-21作为治疗PNI的新战略提供了理论基础。。。
图2:外泌体miR-21调控坐骨神经远端基因表达水平
Yu-pu Liu et al., Oxidative Medicine and Cellular Longevity. 2022 Jan 29.
★细胞系:施万细胞(周围神经系统中的神经胶质细胞称施万细胞)
★基因调控手段:基因过表达(LV-miR-21-5p-OE)
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案例3——慢病毒&circular RNA(滋扰)
CircMET promotes tumor proliferation by enhancing CDKN2A mRNA decay and upregulating SMAD3
作者单位:南京大学
IF:41.444
circMET (hsa_circ_0082002)是一种泉源于MET基因的环状RNA,,,,其功效尚不完全清晰。。。本研究以circMET上调的Xp11.2易位/NONO-TFE3融合性肾细胞癌(NONO-TFE3 tRCC)为研究工具,,,,探讨其在肿瘤希望和转录后调控中的机制。。。研究批注:NONO-TFE3 tRCC组织和细胞中,,,,NONO-TFE3融合上调circMET的表达,,,,过表达circMET显著增进NONO-TFE3 tRCC的生长。。;;;蒲芯恐な,,,,circMET通过YTHDC1以N6 -甲基腺苷(m6A)依赖的方法被递送到细胞质中。。。circMET通过直接相互作用并召募YTHDF2来增强CDKN2A mRNA的衰减,,,,同时circMET竞争性消除miR-1197并抑制SMAD3 mRNA的表达。。。综上所述,,,,circMET增进NONO-TFE3 tRCC的爆发生长并对CDKN2A和SMAD3均有调控作用。。。circMET有望成为NONO-TFE3 tRCC以及其他高表达circMET的肿瘤治疗的新靶点。。。
图3:高表达circMET增进NONO-TFE3 tRCC的增殖
Yang et al., Molecular Cancer. 2022 Jan 18;21(1):23.
★细胞系:UOK109(泉源于原发性乳头状细胞癌)、786-O(人肾透明细胞癌细胞)
★基因调控手段:基因滋扰(LV-sh circMET)
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案例4——慢病毒&circular RNA(敲低)
Down-regulating Circular RNA Prkcsh suppresses the inflammatory response after spinal cord injury
作者单位:山东大学齐鲁医院
IF:6.058
环状RNA (Circular RNAs, circRNAs)是一类守旧的内源性非编码RNA,,,,加入转录和转录后基因调控,,,,在神经系统中高度富集。。。它们加入多种神经细胞的存活和分解,,,,甚至可能增进卒中后神经功效的恢复。。。研究职员使用小鼠T9脊髓损伤模子判断出脊髓损伤后差别表达的circRNA和miRNA。。。其中,,,,circPrkcsh的表达水平在损伤小鼠和比照小鼠之间保存显著差别。。。肿瘤坏死因子-α(TNF-α)刺激体外作育的星形胶质细胞,,,,用以模拟脊髓损伤后的炎症反应。。。效果批注,,,,在损伤的细胞中circPrkcsh表达升高,,,,miR-488表达降低,,,,同时发明circPrkcsh调控炎症相关基因Ccl2的表达。。。别的,,,,在TNF-α处置惩罚的星形胶质细胞中,,,,circPrkcsh敲低通过上调miR-488的表达降低了Ccl2表达,,,,并镌汰体外炎症因子的渗透。。。综上可知,,,,差别表达的circRNA加入脊髓损伤后的炎症反应,,,,并作为某些miRNA的调理者。。。circPrkcsh可作为miR-488海绵吸附调控Ccl2的表达,,,,为脊髓损伤的治疗提供新的思绪。。。
图4:circPrkcsh在体外通过海绵吸附miR-488调控Ccl2的表达。。。
Jia-Nan Chen et al., Neural Regen Res. 2022 Jan;17(1):144-151.
★细胞系:小鼠星形胶质细胞(原代细胞)
★基因调控手段:基因过表达(LV-miR-488-OE)、基因敲低(LV-miR-488-KD)
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案例5——慢病毒&Long non-coding RNA(过表达)
Long non-coding RNA EVADR induced by Fusobacterium nucleatum infection promotes colorectal cancer metastasis
作者单位:第三军医大学(陆军军医大学)
IF:9.995
具核梭杆菌(F. nucleatum)和长链非编码RNA (lncRNA) EVADR均与结直肠癌(CRC)相关,,,,但它们与CRC转移的关系以及EVADR增进CRC转移的机制尚不清晰。。。我们在这里报告了F. nucleatum增进结直肠癌细胞转移到肝和肺,,,,并且在小鼠模子的CRC转移定植中可以检测到它。。。别的,,,,F. nucleatum可上调EVADR的表达,,,,从而增添CRC细胞体内外转移能力。。。在机制上,,,,EVADR升高可作为Y盒连系卵白1 (YBX1)的???榛Ъ,,,,直接增强上皮-间充质转化(EMT)相关因子的翻译,,,,如Snail, Slug和Zeb1。。。这些效果批注,,,,F. nucleatum诱导的EVADR通过YBX1依赖的翻译增进CRC的转移。。。EVADR/YBX1轴可能有助于F. nucleatum相关CRC转移的预防和治疗。。。
图5:F. nucleatum熏染诱导的EVADR增进结直肠癌转移。。。
Xiaoxue Lu et al., Cell Reports. 2022 Jul 19;40(3):111127.
★细胞系:5种结直肠癌细胞(HCT116, LoVo, SW480, SW620 and HT29)、正常结肠上皮细胞系(NCM460)
★基因调控手段:基因过表达(LV-EVADR-OE)
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案例6——慢病毒&Long non-coding RNA(过表达)
An oxygen-adaptive interaction between SNHG12 and occludin maintains blood-brain barrier integrity
作者单位:中国医科大学
IF:9.995
脑微血管内皮细胞(brain microvascular endothelial cells, BMECs)的细密毗连(Tight junctions, TJs)在维持血脑屏障(blood-brain barrier, BBB)完整性中起着要害作用。。。然而,,,,在心理和病理刺激下,,,,TJs稳固性的准确调控仍然是未知的。。。研究使用RNA免疫沉淀连系二代测序(RIP-seq)和功效判断,,,,发明一个长链非编码RNA (lncRNA)—SNHG12,,,,通过直接与TJ卵白occludin相互作用,,,,对维持BBB的完整性至关主要。。。SNHG12和occludin之间的相互作用是氧顺应性的,,,,可以阻断人BMECs中Itch (E3泛素毗连酶)介导的occludin泛素化和降解。。。小鼠内皮细胞敲除SNHG12基因会导致occludin镌汰和BBB渗漏以及加重缺氧诱导BBB的破损。。。脑内皮细胞过表达外源性SNHG12可减轻缺氧对BBB的损害。。。综上所述,,,,研究发明了一个lncRNA对BBB完整性维持和氧顺应至关主要的直接TJ调理剂——SNHG12。。。
图6:SNHG12和occludin之间的氧顺应性相互作用维持了血脑屏障的完整性。。。
Yuan Li et al., Cell Reports. 2022 Apr 12;39(2):110656.
★细胞系:人/小鼠脑微血管内皮细胞(HBMECs、MBMECs)
★基因调控手段:基因过表达(LV-SNHG12-OE)
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